IMOD est un ensemble de programmes de traitement, de modélisation et d'affichage d'images utilisés pour la reconstruction tomographique et pour la reconstruction 3D de coupes EM en série et de coupes optiques. Le package contient des outils permettant d'assembler et d'aligner des données dans plusieurs types et tailles de piles d'images, de visualiser des données 3D sous n'importe quelle orientation, ainsi que de modéliser et d'afficher les fichiers image. IMOD a été développé principalement par David Mastronarde, Rick Gaudette, Sue Held, Jim Kremer, Quanren Xiong, Suraj Khochare et John Heumann de l'Université du Colorado.

IMOD

IMOD est hébergé sur le serveur Thoth de l'IBIS. Pour accéder au logiciel avec l'interface graphique, vous aurez besoin d'un serveur graphique de type X11 sur votre poste local.

ssh IDUL@thoth.ibis.ulaval.ca -X
module load imod/x.xx.xx
imod